Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA2P48052 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA2P48052 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA2P48052 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPA2P48052 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA2P48052 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA2P48052 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA2P48052 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA2P48052 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA2P48052 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA2P48052 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA2P48052 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA2P48052 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA2P48052 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA2P48052 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA2P48052 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA2P48052 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA2P48052 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA2P48052 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA2P48052 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA2P48052 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA2P48052 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA2P48052 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA2P48052 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA2P48052 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA2P48052 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA2P48052 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA2P48052 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA2P48052 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA2P48052 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA2P48052 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA2P48052 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA2P48052 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA2P48052 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA2P48052 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA2P48052 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA2P48052 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA2P48052 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA2P48052 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA2P48052 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA2P48052 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA2P48052 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA2P48052 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA2P48052 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA2P48052 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA2P48052 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA2P48052 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA2P48052 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA2P48052 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA2P48052 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA2P48052 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA2P48052 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA2P48052 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA2P48052 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA2P48052 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA2P48052 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA2P48052 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA2P48052 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA2P48052 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA2P48052 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA2P48052 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA2P48052 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA2P48052 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA2P48052 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA2P48052 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA2P48052 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA2P48052 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA2P48052 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA2P48052 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA2P48052 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA2P48052 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA2P48052 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA2P48052 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA2P48052 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA2P48052 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPA2P48052 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPA2P48052 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CPA2P48052 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA2P48052 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPA2P48052 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA2P48052 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA2P48052 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA2P48052 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA2P48052 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPA2P48052 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA2P48052 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms