Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL21P46778 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL21P46778 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL21P46778 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL21P46778 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL21P46778 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL21P46778 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL21P46778 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL21P46778 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL21P46778 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL21P46778 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL21P46778 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL21P46778 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL21P46778 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL21P46778 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL21P46778 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL21P46778 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL21P46778 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL21P46778 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL21P46778 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL21P46778 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL21P46778 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL21P46778 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL21P46778 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL21P46778 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL21P46778 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL21P46778 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL21P46778 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL21P46778 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL21P46778 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL21P46778 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL21P46778 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL21P46778 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL21P46778 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL21P46778 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL21P46778 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL21P46778 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL21P46778 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL21P46778 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL21P46778 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL21P46778 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL21P46778 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL21P46778 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL21P46778 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL21P46778 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL21P46778 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL21P46778 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL21P46778 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL21P46778 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL21P46778 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL21P46778 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL21P46778 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL21P46778 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL21P46778 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL21P46778 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432.3 ms