Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTF4P34130 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTF4P34130 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTF4P34130 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NTF4P34130 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTF4P34130 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTF4P34130 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTF4P34130 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NTF4P34130 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NTF4P34130 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NTF4P34130 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTF4P34130 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTF4P34130 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTF4P34130 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NTF4P34130 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTF4P34130 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTF4P34130 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTF4P34130 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NTF4P34130 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF4P34130 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF4P34130 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF4P34130 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF4P34130 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF4P34130 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NTF4P34130 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTF4P34130 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NTF4P34130 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTF4P34130 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTF4P34130 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NTF4P34130 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTF4P34130 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTF4P34130 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NTF4P34130 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NTF4P34130 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTF4P34130 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTF4P34130 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTF4P34130 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NTF4P34130 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF4P34130 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF4P34130 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF4P34130 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NTF4P34130 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTF4P34130 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NTF4P34130 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NTF4P34130 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTF4P34130 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NTF4P34130 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NTF4P34130 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTF4P34130 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTF4P34130 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NTF4P34130 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTF4P34130 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTF4P34130 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTF4P34130 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTF4P34130 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTF4P34130 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTF4P34130 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTF4P34130 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTF4P34130 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTF4P34130 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTF4P34130 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTF4P34130 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms