Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC7A1P30825 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A1P30825 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A1P30825 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms