Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCAP28676 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCAP28676 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCAP28676 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCAP28676 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCAP28676 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCAP28676 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCAP28676 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCAP28676 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCAP28676 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCAP28676 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCAP28676 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCAP28676 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCAP28676 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCAP28676 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCAP28676 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCAP28676 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCAP28676 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCAP28676 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCAP28676 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCAP28676 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCAP28676 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCAP28676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCAP28676 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCAP28676 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCAP28676 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCAP28676 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCAP28676 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCAP28676 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCAP28676 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCAP28676 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCAP28676 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCAP28676 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCAP28676 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCAP28676 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCAP28676 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCAP28676 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCAP28676 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCAP28676 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCAP28676 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCAP28676 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCAP28676 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCAP28676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCAP28676 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCAP28676 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCAP28676 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCAP28676 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCAP28676 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCAP28676 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCAP28676 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCAP28676 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCAP28676 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCAP28676 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCAP28676 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCAP28676 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCAP28676 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCAP28676 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCAP28676 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCAP28676 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCAP28676 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCAP28676 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCAP28676 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCAP28676 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCAP28676 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCAP28676 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCAP28676 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCAP28676 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCAP28676 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCAP28676 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCAP28676 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCAP28676 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCAP28676 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCAP28676 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCAP28676 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCAP28676 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCAP28676 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCAP28676 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCAP28676 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCAP28676 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms