Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POLD1P28340 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLD1P28340 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLD1P28340 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLD1P28340 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLD1P28340 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLD1P28340 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
POLD1P28340 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLD1P28340 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLD1P28340 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLD1P28340 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLD1P28340 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLD1P28340 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLD1P28340 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLD1P28340 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLD1P28340 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLD1P28340 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLD1P28340 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLD1P28340 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLD1P28340 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLD1P28340 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
POLD1P28340 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLD1P28340 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLD1P28340 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLD1P28340 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLD1P28340 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLD1P28340 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLD1P28340 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLD1P28340 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLD1P28340 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLD1P28340 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLD1P28340 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLD1P28340 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
POLD1P28340 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLD1P28340 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLD1P28340 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLD1P28340 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLD1P28340 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLD1P28340 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLD1P28340 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLD1P28340 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLD1P28340 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLD1P28340 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLD1P28340 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLD1P28340 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLD1P28340 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLD1P28340 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLD1P28340 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLD1P28340 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLD1P28340 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLD1P28340 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLD1P28340 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLD1P28340 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLD1P28340 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLD1P28340 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLD1P28340 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLD1P28340 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
POLD1P28340 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
POLD1P28340 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLD1P28340 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLD1P28340 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLD1P28340 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLD1P28340 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLD1P28340 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLD1P28340 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
POLD1P28340 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLD1P28340 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLD1P28340 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
POLD1P28340 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLD1P28340 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLD1P28340 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLD1P28340 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
POLD1P28340 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
POLD1P28340 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLD1P28340 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLD1P28340 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLD1P28340 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLD1P28340 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLD1P28340 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLD1P28340 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLD1P28340 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLD1P28340 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLD1P28340 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLD1P28340 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLD1P28340 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLD1P28340 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLD1P28340 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLD1P28340 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms