Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRDP23468 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRDP23468 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRDP23468 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRDP23468 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
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