Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB1P18505 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRB1P18505 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRB1P18505 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms