Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTPS1P17812 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTPS1P17812 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTPS1P17812 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTPS1P17812 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTPS1P17812 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTPS1P17812 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTPS1P17812 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS1P17812 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms