Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN2P17655 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN2P17655 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAPN2P17655 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN2P17655 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms