Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC1P11940 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC1P11940 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC1P11940 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC1P11940 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms