Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRFP10586 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRFP10586 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRFP10586 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRFP10586 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRFP10586 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms