Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
GLI2P10070 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
GLI2P10070 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GLI2P10070 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
GLI2P10070 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
GLI2P10070 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
GLI2P10070 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GLI2P10070 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GLI2P10070 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GLI2P10070 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GLI2P10070 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GLI2P10070 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GLI2P10070 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GLI2P10070 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GLI2P10070 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
GLI2P10070 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GLI2P10070 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GLI2P10070 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
GLI2P10070 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
GLI2P10070 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
GLI2P10070 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GLI2P10070 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GLI2P10070 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
GLI2P10070 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
GLI2P10070 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GLI2P10070 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GLI2P10070 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GLI2P10070 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GLI2P10070 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
GLI2P10070 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GLI2P10070 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GLI2P10070 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
GLI2P10070 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
GLI2P10070 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
GLI2P10070 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GLI2P10070 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GLI2P10070 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GLI2P10070 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GLI2P10070 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GLI2P10070 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GLI2P10070 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GLI2P10070 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GLI2P10070 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
GLI2P10070 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
GLI2P10070 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
GLI2P10070 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GLI2P10070 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GLI2P10070 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GLI2P10070 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GLI2P10070 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GLI2P10070 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GLI2P10070 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GLI2P10070 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GLI2P10070 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GLI2P10070 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GLI2P10070 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GLI2P10070 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GLI2P10070 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GLI2P10070 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GLI2P10070 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GLI2P10070 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
GLI2P10070 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
GLI2P10070 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
GLI2P10070 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
GLI2P10070 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
GLI2P10070 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
GLI2P10070 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
GLI2P10070 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GLI2P10070 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GLI2P10070 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
GLI2P10070 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
GLI2P10070 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
GLI2P10070 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GLI2P10070 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GLI2P10070 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GLI2P10070 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GLI2P10070 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GLI2P10070 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GLI2P10070 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GLI2P10070 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GLI2P10070 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
GLI2P10070 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
GLI2P10070 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.79
GLI2P10070 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
GLI2P10070 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
GLI2P10070 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GLI2P10070 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GLI2P10070 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GLI2P10070 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GLI2P10070 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GLI2P10070 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms