Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L7P0C7H9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L7P0C7H9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L7P0C7H9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L7P0C7H9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms