Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND1P03886 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND1P03886 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND1P03886 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND1P03886 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms