Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P02748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P02748 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P02748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P02748 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9P02748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C9P02748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9P02748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9P02748 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9P02748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9P02748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9P02748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9P02748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9P02748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9P02748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9P02748 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9P02748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9P02748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9P02748 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9P02748 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9P02748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9P02748 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9P02748 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9P02748 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9P02748 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9P02748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9P02748 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9P02748 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9P02748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9P02748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9P02748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9P02748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9P02748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C9P02748 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9P02748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9P02748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C9P02748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C9P02748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C9P02748 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9P02748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9P02748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9P02748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C9P02748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9P02748 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9P02748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9P02748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C9P02748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C9P02748 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9P02748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9P02748 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9P02748 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms