Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTA1P02549 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTA1P02549 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTA1P02549 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTA1P02549 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms