Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPP01282 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPP01282 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPP01282 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPP01282 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPP01282 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIPP01282 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPP01282 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIPP01282 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPP01282 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPP01282 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPP01282 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPP01282 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPP01282 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPP01282 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPP01282 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPP01282 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPP01282 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPP01282 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPP01282 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPP01282 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPP01282 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPP01282 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPP01282 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPP01282 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPP01282 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPP01282 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPP01282 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPP01282 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPP01282 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPP01282 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPP01282 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPP01282 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPP01282 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPP01282 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VIPP01282 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIPP01282 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIPP01282 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPP01282 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPP01282 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPP01282 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPP01282 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIPP01282 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPP01282 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPP01282 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPP01282 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VIPP01282 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPP01282 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPP01282 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPP01282 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VIPP01282 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VIPP01282 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPP01282 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPP01282 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPP01282 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPP01282 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VIPP01282 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPP01282 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPP01282 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPP01282 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPP01282 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPP01282 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VIPP01282 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPP01282 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPP01282 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPP01282 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPP01282 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPP01282 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VIPP01282 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPP01282 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPP01282 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VIPP01282 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPP01282 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPP01282 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms