Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFDP00746 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFDP00746 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFDP00746 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFDP00746 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFDP00746 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFDP00746 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFDP00746 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFDP00746 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFDP00746 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFDP00746 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFDP00746 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFDP00746 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFDP00746 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFDP00746 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFDP00746 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFDP00746 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFDP00746 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFDP00746 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFDP00746 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFDP00746 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFDP00746 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFDP00746 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFDP00746 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFDP00746 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFDP00746 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFDP00746 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFDP00746 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFDP00746 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CFDP00746 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFDP00746 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CFDP00746 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CFDP00746 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CFDP00746 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CFDP00746 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CFDP00746 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CFDP00746 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CFDP00746 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CFDP00746 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CFDP00746 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CFDP00746 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CFDP00746 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CFDP00746 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CFDP00746 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CFDP00746 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CFDP00746 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CFDP00746 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CFDP00746 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CFDP00746 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CFDP00746 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CFDP00746 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CFDP00746 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CFDP00746 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFDP00746 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFDP00746 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFDP00746 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFDP00746 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFDP00746 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFDP00746 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFDP00746 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFDP00746 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFDP00746 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFDP00746 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFDP00746 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFDP00746 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFDP00746 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFDP00746 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFDP00746 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CFDP00746 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFDP00746 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFDP00746 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFDP00746 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFDP00746 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms