Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEACAM4O75871 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM4O75871 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM4O75871 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms