Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7O15265 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7O15265 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN7O15265 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN7O15265 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATXN7O15265 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN7O15265 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN7O15265 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms