Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CITO14578 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CITO14578 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CITO14578 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CITO14578 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CITO14578 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CITO14578 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CITO14578 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CITO14578 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CITO14578 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CITO14578 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CITO14578 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CITO14578 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CITO14578 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CITO14578 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CITO14578 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CITO14578 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CITO14578 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CITO14578 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CITO14578 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CITO14578 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CITO14578 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CITO14578 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CITO14578 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CITO14578 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CITO14578 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CITO14578 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CITO14578 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CITO14578 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CITO14578 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CITO14578 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CITO14578 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CITO14578 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CITO14578 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CITO14578 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CITO14578 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CITO14578 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CITO14578 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CITO14578 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CITO14578 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CITO14578 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CITO14578 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CITO14578 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CITO14578 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CITO14578 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CITO14578 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CITO14578 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CITO14578 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CITO14578 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CITO14578 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CITO14578 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CITO14578 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CITO14578 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CITO14578 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CITO14578 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CITO14578 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CITO14578 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CITO14578 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CITO14578 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CITO14578 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CITO14578 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CITO14578 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CITO14578 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CITO14578 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CITO14578 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CITO14578 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CITO14578 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CITO14578 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CITO14578 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CITO14578 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CITO14578 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CITO14578 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CITO14578 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CITO14578 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CITO14578 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CITO14578 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CITO14578 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CITO14578 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CITO14578 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CITO14578 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CITO14578 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CITO14578 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CITO14578 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CITO14578 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms