Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRE1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRE1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRE1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRE1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRE1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRE1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRE1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRE1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRE1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRE1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRE1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRE1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QRE1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QRE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QRE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QRE1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QRE1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QRE1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QRE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QRE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QRE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRE1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRE1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRE1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QRE1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QRE1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRE1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRE1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRE1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QRE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRE1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRE1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3QRE1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3QRE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRE1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRE1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRE1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3QRE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRE1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3QRE1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRE1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRE1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3QRE1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3QRE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3QRE1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRE1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRE1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QRE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QRE1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
J3QRE1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
J3QRE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRE1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QRE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms