Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN34H7C241 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN34H7C241 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms