Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BSA7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSA7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSA7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BSA7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BSA7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSA7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSA7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSA7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms