Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BSA7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BSA7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BSA7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BSA7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BSA7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BSA7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BSA7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BSA7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSA7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BSA7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BSA7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BSA7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BSA7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BSA7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BSA7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BSA7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BSA7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BSA7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSA7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSA7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BSA7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BSA7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BSA7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms