Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8VRH5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8VRH5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8VRH5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8VRH5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8VRH5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8VRH5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8VRH5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8VRH5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F8VRH5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8VRH5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8VRH5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8VRH5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8VRH5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8VRH5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F8VRH5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8VRH5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8VRH5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
F8VRH5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8VRH5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8VRH5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8VRH5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8VRH5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8VRH5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
F8VRH5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F8VRH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8VRH5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8VRH5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8VRH5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms