Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BHMG1C9JSJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BHMG1C9JSJ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMG1C9JSJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms