Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6CA6NDK9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GOLGA6CA6NDK9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6CA6NDK9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms