Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC35F4A4IF30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC35F4A4IF30 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35F4A4IF30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35F4A4IF30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35F4A4IF30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35F4A4IF30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35F4A4IF30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35F4A4IF30 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35F4A4IF30 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms