Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC2BA2VCK2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCDC2BA2VCK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DCDC2BA2VCK2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms