Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WVE0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WVE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WVE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WVE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WVE0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A087WVE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A087WVE0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A087WVE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A087WVE0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A087WVE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A087WVE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A087WVE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A087WVE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A087WVE0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A087WVE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A087WVE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms