Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms