Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms