RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261038.5

DIRC2-201, Transcript of disrupted in renal carcinoma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DIRC2, Length 3,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC2-201ENST00000261038 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.02■■■□□ 2.56
DIRC2-201ENST00000261038 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
DIRC2-201ENST00000261038 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.09■■■□□ 2.09
DIRC2-201ENST00000261038 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.64■■■□□ 2.02
DIRC2-201ENST00000261038 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.6■■■□□ 2.01
DIRC2-201ENST00000261038 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
DIRC2-201ENST00000261038 HRCP23327 699 aa27.38■■□□□ 1.97
DIRC2-201ENST00000261038 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.8■■□□□ 1.88
DIRC2-201ENST00000261038 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.71■■□□□ 1.87
DIRC2-201ENST00000261038 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.7■■□□□ 1.86
DIRC2-201ENST00000261038 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.49■■□□□ 1.83
DIRC2-201ENST00000261038 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
DIRC2-201ENST00000261038 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
DIRC2-201ENST00000261038 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
DIRC2-201ENST00000261038 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
DIRC2-201ENST00000261038 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
DIRC2-201ENST00000261038 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
DIRC2-201ENST00000261038 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
DIRC2-201ENST00000261038 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.68■■□□□ 1.7
DIRC2-201ENST00000261038 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
DIRC2-201ENST00000261038 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
DIRC2-201ENST00000261038 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
DIRC2-201ENST00000261038 TRIM41Q8WV44 630 aa25.59■■□□□ 1.69
DIRC2-201ENST00000261038 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.58■■□□□ 1.69
DIRC2-201ENST00000261038 NEUROD1Q13562 356 aa25.54■■□□□ 1.68
DIRC2-201ENST00000261038 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.42■■□□□ 1.66
DIRC2-201ENST00000261038 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
DIRC2-201ENST00000261038 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
DIRC2-201ENST00000261038 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
DIRC2-201ENST00000261038 MYT1Q01538 1121 aa25.15■■□□□ 1.62
DIRC2-201ENST00000261038 SCRIBQ14160 1630 aa25.03■■□□□ 1.6
DIRC2-201ENST00000261038 ABCC9O60706 1549 aa24.91■■□□□ 1.58
DIRC2-201ENST00000261038 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
DIRC2-201ENST00000261038 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
DIRC2-201ENST00000261038 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
DIRC2-201ENST00000261038 MIER1Q8N108 512 aa24.63■■□□□ 1.53
DIRC2-201ENST00000261038 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
DIRC2-201ENST00000261038 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
DIRC2-201ENST00000261038 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.58■■□□□ 1.52
DIRC2-201ENST00000261038 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.52■■□□□ 1.52
DIRC2-201ENST00000261038 BCANQ96GW7 911 aa24.47■■□□□ 1.51
DIRC2-201ENST00000261038 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
DIRC2-201ENST00000261038 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.29■■□□□ 1.48
DIRC2-201ENST00000261038 BCL11AQ9H165 835 aa24.25■■□□□ 1.47
DIRC2-201ENST00000261038 APLP2Q06481 763 aa24.24■■□□□ 1.47
DIRC2-201ENST00000261038 ITGAEP38570 1179 aa24.13■■□□□ 1.45
DIRC2-201ENST00000261038 WIZO95785 1651 aa24.12■■□□□ 1.45
DIRC2-201ENST00000261038 NACADO15069 1562 aa24.08■■□□□ 1.45
DIRC2-201ENST00000261038 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.05■■□□□ 1.44
DIRC2-201ENST00000261038 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
DIRC2-201ENST00000261038 ABCC8Q09428 1581 aa23.96■■□□□ 1.43
DIRC2-201ENST00000261038 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.94■■□□□ 1.42
DIRC2-201ENST00000261038 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.9■■□□□ 1.42
DIRC2-201ENST00000261038 SOGA1O94964 1423 aa23.9■■□□□ 1.42
DIRC2-201ENST00000261038 CEP162Q5TB80 1403 aa23.89■■□□□ 1.42
DIRC2-201ENST00000261038 FKBP8Q14318 412 aa23.86■■□□□ 1.41
DIRC2-201ENST00000261038 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.86■■□□□ 1.41
DIRC2-201ENST00000261038 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.86■■□□□ 1.41
DIRC2-201ENST00000261038 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
DIRC2-201ENST00000261038 KCNH8Q96L42 1107 aa23.83■■□□□ 1.41
DIRC2-201ENST00000261038 NEFLP07196 543 aa23.76■■□□□ 1.39
DIRC2-201ENST00000261038 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
DIRC2-201ENST00000261038 TRIM52Q96A61 297 aa23.7■■□□□ 1.38
DIRC2-201ENST00000261038 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.69■■□□□ 1.38
DIRC2-201ENST00000261038 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.67■■□□□ 1.38
DIRC2-201ENST00000261038 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
DIRC2-201ENST00000261038 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
DIRC2-201ENST00000261038 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
DIRC2-201ENST00000261038 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
DIRC2-201ENST00000261038 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
DIRC2-201ENST00000261038 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
DIRC2-201ENST00000261038 GOLGA3Q08378 1498 aa23.53■■□□□ 1.36
DIRC2-201ENST00000261038 CLIP1P30622 1438 aa23.51■■□□□ 1.35
DIRC2-201ENST00000261038 SMARCA4P51532 1647 aa23.49■■□□□ 1.35
DIRC2-201ENST00000261038 EEA1Q15075 1411 aa23.47■■□□□ 1.35
DIRC2-201ENST00000261038 SMARCA2P51531 1590 aa23.45■■□□□ 1.35
DIRC2-201ENST00000261038 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
DIRC2-201ENST00000261038 NBR1Q14596 966 aa23.34■■□□□ 1.33
DIRC2-201ENST00000261038 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.33■■□□□ 1.33
DIRC2-201ENST00000261038 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
DIRC2-201ENST00000261038 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.27■■□□□ 1.32
DIRC2-201ENST00000261038 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.26■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.26■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 ANP32CO43423 234 aa23.21■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.21■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
DIRC2-201ENST00000261038 P3H3Q8IVL6 736 aa23.2■■□□□ 1.3
DIRC2-201ENST00000261038 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
DIRC2-201ENST00000261038 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.19■■□□□ 1.3
DIRC2-201ENST00000261038 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
DIRC2-201ENST00000261038 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
DIRC2-201ENST00000261038 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
DIRC2-201ENST00000261038 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.09■■□□□ 1.29
DIRC2-201ENST00000261038 SYNJ1O43426 1573 aa23.08■■□□□ 1.28
DIRC2-201ENST00000261038 MSH5O43196 834 aa23.07■■□□□ 1.28
DIRC2-201ENST00000261038 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.07■■□□□ 1.28
DIRC2-201ENST00000261038 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms