Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMF1-BGLAPU3KQ54 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms