Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.4■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.31■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.28■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms