Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYVE1Q9Y5Y7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYVE1Q9Y5Y7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms