Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms