Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PAXBP1Q9Y5B6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms