Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN3Q9Y4C0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
NRXN3Q9Y4C0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN3Q9Y4C0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NRXN3Q9Y4C0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NRXN3Q9Y4C0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN3Q9Y4C0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms