Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIT1Q9Y3P8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIT1Q9Y3P8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIT1Q9Y3P8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIT1Q9Y3P8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms