Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM2Q9Y333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM2Q9Y333 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms