Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms