Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4AQ9UMR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4AQ9UMR7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4AQ9UMR7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4AQ9UMR7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms