Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH7Q9ULB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH7Q9ULB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH7Q9ULB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms