Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF2Q9UK05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF2Q9UK05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF2Q9UK05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms