Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC23Q9UJX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC23Q9UJX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC23Q9UJX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDC23Q9UJX2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms