Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OPN4Q9UHM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OPN4Q9UHM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN4Q9UHM6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms