Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDP2Q9P2J9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDP2Q9P2J9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDP2Q9P2J9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDP2Q9P2J9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms