Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms